技术文章
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宝德HPC为罗湖医院集团注入“洪荒之力”
近期,宝德服务器中标深圳市罗湖医院集团(以下简称“罗湖医院集团”)采购项目,宝德为罗湖医院集团量身设计了一套HPC解决方案,将为其开展生物信息分析提供的计算基础平台。
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作为探索医改新模式的,罗湖医院集团由区人民医院、区中医院、区妇幼保健院、区康复医院、区医养融合老年病科医院组成,下设检验中心、影像中心等十二大中心。罗湖医院集团致力于加大人才引进与培养力度,从国内外院所引进众多医教研复合型人才,新引进专家承担着国家自然科学基金、国家“863”等重大科研项目。
生物信息学是在生命科学的研究中以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学,其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面。在生物信息分析中通常采用DNA捕获技术进行基因测序,从而能够进行大规模的基因研究或筛查,把基因组DNA序列信息分析作为源头,在获得蛋白质编码区的信息后进行蛋白质空间结构模拟和预测,然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。
随着在基因测序研究中分析处理的数据量的迅猛飙升,罗湖医院集团面临着海量信息的存储和分析挑战,从而对高性能计算集群以及其运算能力、存储能力等提出了更高的需求,希望通过构建更强大的计算平台不断提升大规模信息处理的能力。
针对本次项目需求,宝德为罗湖医院集团打造了一套具有高性能、高容量、高可用、高可靠特点的高性能计算集群。其中,宝德服务器PR2012GS2作为管理与登录节点服务器, PR2780HW作为四子星计算服务器, PR4860R作为大内存计算服务器, PR4036GS2作为二级存储服务器。
分割线
多年来,宝德坚持在HPC市场积极探索创新的应用,在基因测序等生物信息学领域,宝德HPC早有涉猎且拥有丰富的建设经验。宝德与zui大的基因组学研发机构——华大基因长期保持着深入合作,并取得了多项瞩目成就:华大基因黄种人基因图谱“炎黄一号”项目大量应用了宝德高密度计算的双子星服务器,促进*张“黄种人基因图谱”提早面世;随后在大熊猫基因项目中,华大基因也全套采用了宝德的存储服务器以及高密度计算节点。此外,宝德还帮助中国科学院北京生命科学研究院、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所等机构建立了*套高性能计算机集群,为加快国内生物信息科学研究和技术成果的转化进程做出了重要的贡献。
    
 